Forwarded from Saeed
🌺🌹🌻کاربرد سوم: تولید طلای خالص
https://telegram.me/biotechnology1
uses the bacteria Cupriavidus metallidurans to turn gold chlroride—a toxic chemical liquid you can find in nature—into 99.9% pure gold.
Also it plays a vital role, together with the species Delftia acidovorans, in the formation of gold nuggets , by precipitating metallic gold from a solution of gold (III) chloride, a compound highly toxic to most other microorganisms.
دلیل مقاومت به سمیت
strain CH34 is adapted to the outlined harsh conditions by a multitude of heavy-metal resistance systems that are encoded by the two indigenous megaplasmids pMOL28 and pMOL30 on the bacterial chromosome(s).
https://telegram.me/biotechnology1
uses the bacteria Cupriavidus metallidurans to turn gold chlroride—a toxic chemical liquid you can find in nature—into 99.9% pure gold.
Also it plays a vital role, together with the species Delftia acidovorans, in the formation of gold nuggets , by precipitating metallic gold from a solution of gold (III) chloride, a compound highly toxic to most other microorganisms.
دلیل مقاومت به سمیت
strain CH34 is adapted to the outlined harsh conditions by a multitude of heavy-metal resistance systems that are encoded by the two indigenous megaplasmids pMOL28 and pMOL30 on the bacterial chromosome(s).
با سلام ☺✋در این پست به طور خیلی خلاصه به مبحث بیوتکنولوژی گیاهی می پردازیم☺🌺
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹 گیاهان ترانسژنیک 🌺🌻🌹
1) اولین گیاه GM پرورش یافته برای برای فروش در بازار ایالات متحده گوجه فرنگی ای بود که با به تعویق انداختن فساد درآن ، عمر مفید آن افزایش یافته بود.
علاوه بر این ، گیاهان تراریخت را می توان همانند میکروارگانیسم ها و جانوران ، برای تولید محصولات تجاری یا دارویی از نظر ژنتیکی مهندسی کرد.
2) برای مثال گیاهان زراعی مانند تنباکو و گوجه فرنگی به منظور تولید تعدادی از محصولات ، مانند پروتیین اینترفرون انسانی مهندسی شده اند. همچنین می توان از این گیاهان زراعی برای تولید آنتی بادی های انسانی استفاده کرد که به آن" پلنتی بادی" می گویند که از آن به عنوان داروهای ضد سرطان یا ضد ویروس می توان استفاده کرد.
3)ساخت آنتی بادی در گیاهان 🌺🌻🌹
برای مثال از گیاه تنباکوی تراریخت برای ساخت آنتی بادی به نام CaroRxکه باکتری ایجاد کننده ی پوسیدگی دندان را از حمله به دندان باز می دارد، مورد استفاده قرار می گیرد. CaroRxدر سطوح بالایی در برگ های تنباکو ساخته می شود و خالص سازی آن نسبتا ساده است. تاکنون آزمایشات بالینی آن ها بی خطر و موثر نشان داده اند. گیاهان در تولید این نوع محصولات کارآمد هستند چون می توانند پروتیین ها را به درستی تغییر دهند.
https://telegram.me/biotechnology1
4) ساخت واکسن بوسیله گیاهان 🌺🌻🌹
گیاهان زراعی هم چنین برای تولید واکسن ها پرورش یافته اند.
بدین گونه که ما میتوانیم یک ویروس موزاییک تنباکو را برای بیان پروتیین سطحی Plasmodium vivax که یکی از انگل های میکروبی مولد مالاریا است، مهندسی ژنتیکی بکنیم. سپس می توان از تنباکو و گوجه فرنگی آلوده با این ویروس مهندسی ژنتیک برای تولید واکسن مالاریا با هزینه اندک و در مقادیر بالا استفاده کرد که پروتیین های P.vivaxدر انسان ها پاسخ ایمنی ایجاد می کنند.
روش جالب دیگر تولید واکسن های خوراکی در یک محصول گیاهی خوراکی است. واکسن های خوراکی که می توانند انسان را در برابر بیماری های ایجاد شده توسط باکتری های روده ای مثل وبا و اسهال ایمن سازند.
5) یک نوع گیاه تراریخت نسبتا متفاوت سیب زمینی آمفلورا است که توسط BASF، یک کمپانی مواد شیمیایی آلمانی، ایجاد شده است. سیب زمینی آمفلورا برای خوردن طراحی نشده است. برخلاف سیب زمینی های معمولی که دو نوع نشاسته آمیلوپکتین و آمیلوز تولید می کنند، سیب زمنی آمفلورا تنها آمیلوپکتین تولید می کند، که یکی از مواد خام مورد استفاده در صنایع کاغذسازی و تولید چسب است. استفاده از سیب زمینی آمفلورا موجب می شود که ما عمل پرهزینه و انرژی بر خالص سازی آمیلوز را از آمیلوپکتین انجام ندهیم. 🌷🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹 گیاهان ترانسژنیک 🌺🌻🌹
1) اولین گیاه GM پرورش یافته برای برای فروش در بازار ایالات متحده گوجه فرنگی ای بود که با به تعویق انداختن فساد درآن ، عمر مفید آن افزایش یافته بود.
علاوه بر این ، گیاهان تراریخت را می توان همانند میکروارگانیسم ها و جانوران ، برای تولید محصولات تجاری یا دارویی از نظر ژنتیکی مهندسی کرد.
2) برای مثال گیاهان زراعی مانند تنباکو و گوجه فرنگی به منظور تولید تعدادی از محصولات ، مانند پروتیین اینترفرون انسانی مهندسی شده اند. همچنین می توان از این گیاهان زراعی برای تولید آنتی بادی های انسانی استفاده کرد که به آن" پلنتی بادی" می گویند که از آن به عنوان داروهای ضد سرطان یا ضد ویروس می توان استفاده کرد.
3)ساخت آنتی بادی در گیاهان 🌺🌻🌹
برای مثال از گیاه تنباکوی تراریخت برای ساخت آنتی بادی به نام CaroRxکه باکتری ایجاد کننده ی پوسیدگی دندان را از حمله به دندان باز می دارد، مورد استفاده قرار می گیرد. CaroRxدر سطوح بالایی در برگ های تنباکو ساخته می شود و خالص سازی آن نسبتا ساده است. تاکنون آزمایشات بالینی آن ها بی خطر و موثر نشان داده اند. گیاهان در تولید این نوع محصولات کارآمد هستند چون می توانند پروتیین ها را به درستی تغییر دهند.
https://telegram.me/biotechnology1
4) ساخت واکسن بوسیله گیاهان 🌺🌻🌹
گیاهان زراعی هم چنین برای تولید واکسن ها پرورش یافته اند.
بدین گونه که ما میتوانیم یک ویروس موزاییک تنباکو را برای بیان پروتیین سطحی Plasmodium vivax که یکی از انگل های میکروبی مولد مالاریا است، مهندسی ژنتیکی بکنیم. سپس می توان از تنباکو و گوجه فرنگی آلوده با این ویروس مهندسی ژنتیک برای تولید واکسن مالاریا با هزینه اندک و در مقادیر بالا استفاده کرد که پروتیین های P.vivaxدر انسان ها پاسخ ایمنی ایجاد می کنند.
روش جالب دیگر تولید واکسن های خوراکی در یک محصول گیاهی خوراکی است. واکسن های خوراکی که می توانند انسان را در برابر بیماری های ایجاد شده توسط باکتری های روده ای مثل وبا و اسهال ایمن سازند.
5) یک نوع گیاه تراریخت نسبتا متفاوت سیب زمینی آمفلورا است که توسط BASF، یک کمپانی مواد شیمیایی آلمانی، ایجاد شده است. سیب زمینی آمفلورا برای خوردن طراحی نشده است. برخلاف سیب زمینی های معمولی که دو نوع نشاسته آمیلوپکتین و آمیلوز تولید می کنند، سیب زمنی آمفلورا تنها آمیلوپکتین تولید می کند، که یکی از مواد خام مورد استفاده در صنایع کاغذسازی و تولید چسب است. استفاده از سیب زمینی آمفلورا موجب می شود که ما عمل پرهزینه و انرژی بر خالص سازی آمیلوز را از آمیلوپکتین انجام ندهیم. 🌷🌺🌻🌹
🌹🌻🌺درنسل چهارم دستگاههای تعیین توالی DNA تعيين توالي به روش Nanopore Sequencing
🌹🌻🌺
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
در این روش DNA را به‌صورت تک رشته‌ای از درون سوراخ‌های بسیار ریزی عبور می‌دهند و میزان اختلاف پتانسیل در دو سمت سوراخ هنگام عبور نوکلئوتیدها اندازه‌گیری می‌شود. هر نوکلئوتید به‌میزان متفاوتی می‌تواند در جریان تغییر ایجاد کند. قطر کانالی که DNA از آن عبور میکند حدود 25 نانومتر می‌باشد. این کانال‌ها می‌توانند از جنس پلی لایزین باشند و به کانال نانوپور یا کانال آلکالان معروفند. هر نوکلئوتید بنابر مقاومت الکتریکی که دارد هنگام عبور سبب کاهش جریان در آمپر سنج می‌شود. در این روش پلیمریزاسیون صورت نمی‌گیرد.روش انجام کار به این ترتیب است که ابتدا DNA را به قطعات کوچک تقسیم می‌کنند و به‌صورت تک رشته‌ای در می‌آورند. سپس در سمت آن یک آداپتور با توالی مشخص اضافه می‌کنند. رشته DNA از بخش آداپتور و از طریق PEG به یک بیوتین که خود به یک استرپتوآویدین متصل است، وصل می شود. اتصال B-S به انتهاي 5' رشته الگو اين اطمينان را به اپراتور مي¬دهد كه رشته الگو حتماً از سمت 3' خود وارد نانوپور مي¬شود.
🌹🌻🌺
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
در این روش DNA را به‌صورت تک رشته‌ای از درون سوراخ‌های بسیار ریزی عبور می‌دهند و میزان اختلاف پتانسیل در دو سمت سوراخ هنگام عبور نوکلئوتیدها اندازه‌گیری می‌شود. هر نوکلئوتید به‌میزان متفاوتی می‌تواند در جریان تغییر ایجاد کند. قطر کانالی که DNA از آن عبور میکند حدود 25 نانومتر می‌باشد. این کانال‌ها می‌توانند از جنس پلی لایزین باشند و به کانال نانوپور یا کانال آلکالان معروفند. هر نوکلئوتید بنابر مقاومت الکتریکی که دارد هنگام عبور سبب کاهش جریان در آمپر سنج می‌شود. در این روش پلیمریزاسیون صورت نمی‌گیرد.روش انجام کار به این ترتیب است که ابتدا DNA را به قطعات کوچک تقسیم می‌کنند و به‌صورت تک رشته‌ای در می‌آورند. سپس در سمت آن یک آداپتور با توالی مشخص اضافه می‌کنند. رشته DNA از بخش آداپتور و از طریق PEG به یک بیوتین که خود به یک استرپتوآویدین متصل است، وصل می شود. اتصال B-S به انتهاي 5' رشته الگو اين اطمينان را به اپراتور مي¬دهد كه رشته الگو حتماً از سمت 3' خود وارد نانوپور مي¬شود.
Forwarded from Saeed
Oxford Nanopore Technologies.mp4
9.6 MB
Forwarded from Saeed
DNA Quantitation Using a Spectrophotometer.mp4
11.2 MB
Saeed
DNA Quantitation Using a Spectrophotometer.mp4
DNA Quantitation Using a Spectrophotometer
Forwarded from Saeed
Restriction digest of DNA.mp4
16.8 MB
Forwarded from Saeed
Making microbiological media.mp4
17.7 MB
Saeed
Making microbiological media.mp4
Making microbiological media
🌹🌻🌺باکتری های مولد هسته یخ 🌺🌻🌹
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
گروهی از باکتری ها وجود دارد که موجب تبدیل آب به یخ می شوند. این فرایند به وسیله پروتیین های موجود در سطح باکتری ها انجام می شود که به اسم فاکتور هسته یخ (ice nucleation factors) شناخته می شوند،کاتالیز می شود.این باکتری ها در سطح گیاهان وجود دارند. این باکتری ها با فعالیت و افزایش جمعیت خود به وقوع سرمازدگی گیاهان در دماهای بالاتر از معمول کمک می نمایند به عبارت دیگر باعث یخ زدن آب در دماهای گرم تر از دمای معمول می شود. باکتری های Pseudomonase syringae ،Pseudomonas fluorescens،Pantoea agglomerans و Xanthaomonas spp به عنوان باکتری های مولد هسته یخ شناسایی شده اند. یشترین دلیل سرمازدگی گیاهان پروتیین های سطحی باکتری هایی می باشد که بر روی سطح گیاهان وجود دارد ،به خصوص سودوموناس سیرنگی که بیشترین فعالیت هسته یخ دربین گونه های مربوطه دارد. تشکیل کریستال های یخ به بافت های گیاه آسیب می رساند و فرآیند انتقال آب و مواد غذایی که به وسیله آوندها (xylem and phloem) انجام می شود را قطع میکند. اگر این باکتری ها حضور نداشته باشند یخ تشکیل نمی شود ، در عوض دمای آب به زیر نقطه انجماد می رسد و گیاهان آسیب نمی بینند.
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
گروهی از باکتری ها وجود دارد که موجب تبدیل آب به یخ می شوند. این فرایند به وسیله پروتیین های موجود در سطح باکتری ها انجام می شود که به اسم فاکتور هسته یخ (ice nucleation factors) شناخته می شوند،کاتالیز می شود.این باکتری ها در سطح گیاهان وجود دارند. این باکتری ها با فعالیت و افزایش جمعیت خود به وقوع سرمازدگی گیاهان در دماهای بالاتر از معمول کمک می نمایند به عبارت دیگر باعث یخ زدن آب در دماهای گرم تر از دمای معمول می شود. باکتری های Pseudomonase syringae ،Pseudomonas fluorescens،Pantoea agglomerans و Xanthaomonas spp به عنوان باکتری های مولد هسته یخ شناسایی شده اند. یشترین دلیل سرمازدگی گیاهان پروتیین های سطحی باکتری هایی می باشد که بر روی سطح گیاهان وجود دارد ،به خصوص سودوموناس سیرنگی که بیشترین فعالیت هسته یخ دربین گونه های مربوطه دارد. تشکیل کریستال های یخ به بافت های گیاه آسیب می رساند و فرآیند انتقال آب و مواد غذایی که به وسیله آوندها (xylem and phloem) انجام می شود را قطع میکند. اگر این باکتری ها حضور نداشته باشند یخ تشکیل نمی شود ، در عوض دمای آب به زیر نقطه انجماد می رسد و گیاهان آسیب نمی بینند.
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
🌹🌺🌻محافظت از گیاهان در برابر سرمازدگی از راه مهندسی باکتری های همزیست
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
سرما و یخ زدگی همه ساله خسارات قابل توجهی را به اقتصاد و چرخه تولید کشور تحمیل می کند و سرما و یخ زدگی یکی از مهم ترین عوامل خسارت زا محصولات کشاورزی محسوب می شود.
یکی از نخستین مثال های اصلاح موفقیت آمیز باکتری های همزیست در مورد باکتری سودوموناس سیرینگی صادق است. این باکتری به مقدار زیاد در سطح برگ های بسیاری از گیاهان یافت می شود.
ظاهرا بسیاری از سویه های این باکتری ، پروتیین یخ سازی در سطح سلول های خود تولید می کنند و وجود این پروتیین ها، موجب تشکیل یخ در کمی بالاتر از صفر درجه سانتی گراد می شود که این پروتیین گیاهان زراعی را وادار به یخ زدن می کند و تهاجم بعدی باکتری ها را به بافت های گیاهی آسان می سازد. این پروتیین به وسیله ژن inaZ کد می شود. همانند بسیاری از باکتری ها، باکتری E.Coliچنین توانایی را ندارد، اگر چه، اگر ژن InaZدر آن کلون کنیم، با بیان این ژن، توانایی فعالیت هسته یخ را پیدا می کند. حال اگر این ژن در سودوموناس سیرنگی تخریب شود، این توانایی را از دست می دهد.
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
استیون لیندا و همکارانش ابتدا ژن عامل تشکیل هسته ی یخ در سودوموناس سیرینگی را با استفاده از ناقل کاسمیدی در باکتری اشریشیا کلای کلون کردند. سپس سلول های اشریشیا کلای دریافت کننده ی DNAنوترکیب برای تشکیل هسته یخ در -9 درجه سانتی گراد مورد جستجو قرار گرفتند. به روشDNAنوترکیب همولوگ قسمتی از این ژن حذف گردید و باقیمانده دوباره به روش مشابه به کروموزوم سودوموناس سیرینگی بازگردانده شد. بدین ترتیب سویه های آیس منفی (Ice-)بدست آمدند. سویه های آیس منفی در همه ی خواص دیگر خود، به جز قابلیت تشکیل هسته ی یخ شبیه سویه والدی خود یعنی آیس مثبت بودند. وقتی سویه های جهش یافته (Ice-)در سطح برگ های توت فرنگی اسپری می کنند این باکتری ها بر سطح برگ های گیاه مستقر می شوند که می توانند با موفقیت با باکتری های تیپ های حشی (Ice+)رقابت می کردند و بدین وسیله گیاهان را از آسیب یخ زدن محافظت می کنند.
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
سرما و یخ زدگی همه ساله خسارات قابل توجهی را به اقتصاد و چرخه تولید کشور تحمیل می کند و سرما و یخ زدگی یکی از مهم ترین عوامل خسارت زا محصولات کشاورزی محسوب می شود.
یکی از نخستین مثال های اصلاح موفقیت آمیز باکتری های همزیست در مورد باکتری سودوموناس سیرینگی صادق است. این باکتری به مقدار زیاد در سطح برگ های بسیاری از گیاهان یافت می شود.
ظاهرا بسیاری از سویه های این باکتری ، پروتیین یخ سازی در سطح سلول های خود تولید می کنند و وجود این پروتیین ها، موجب تشکیل یخ در کمی بالاتر از صفر درجه سانتی گراد می شود که این پروتیین گیاهان زراعی را وادار به یخ زدن می کند و تهاجم بعدی باکتری ها را به بافت های گیاهی آسان می سازد. این پروتیین به وسیله ژن inaZ کد می شود. همانند بسیاری از باکتری ها، باکتری E.Coliچنین توانایی را ندارد، اگر چه، اگر ژن InaZدر آن کلون کنیم، با بیان این ژن، توانایی فعالیت هسته یخ را پیدا می کند. حال اگر این ژن در سودوموناس سیرنگی تخریب شود، این توانایی را از دست می دهد.
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
استیون لیندا و همکارانش ابتدا ژن عامل تشکیل هسته ی یخ در سودوموناس سیرینگی را با استفاده از ناقل کاسمیدی در باکتری اشریشیا کلای کلون کردند. سپس سلول های اشریشیا کلای دریافت کننده ی DNAنوترکیب برای تشکیل هسته یخ در -9 درجه سانتی گراد مورد جستجو قرار گرفتند. به روشDNAنوترکیب همولوگ قسمتی از این ژن حذف گردید و باقیمانده دوباره به روش مشابه به کروموزوم سودوموناس سیرینگی بازگردانده شد. بدین ترتیب سویه های آیس منفی (Ice-)بدست آمدند. سویه های آیس منفی در همه ی خواص دیگر خود، به جز قابلیت تشکیل هسته ی یخ شبیه سویه والدی خود یعنی آیس مثبت بودند. وقتی سویه های جهش یافته (Ice-)در سطح برگ های توت فرنگی اسپری می کنند این باکتری ها بر سطح برگ های گیاه مستقر می شوند که می توانند با موفقیت با باکتری های تیپ های حشی (Ice+)رقابت می کردند و بدین وسیله گیاهان را از آسیب یخ زدن محافظت می کنند.
باکتری آیس منفی به گونه هایی از سودوموناس سیرنگی گفته می شود که فاقد توانایی تولید پروتیین سطحی هست که در تیپ وحشی سودوموناس سیرنگی است.
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
🌹🌺🌻نقش باکتری های مولد هسته یخ در باران سازی
وقتی باکتری های یخ ساز بر سطح گیاهان کلونی تشکیل می دهند ، وزش باد موجب می شود تا این باکتری وارد اتمسفر شوند ، زمانی که این باکتری ها وارد ابرها بشوند ، کریستال های یخ اطراف آن ها تشکیل می شود سپس سایر مولکول های بخار آب به این کریستال یخ متصل می شود و باعث می شود که این کریستال ها بزرگ تر و بزرگ تر بشود تا در نهایت کریستال های یخ تشکیل می شود که به صورت باران یا برف به سطح زمین می بارد. وقتی که این رسوب رخ دهد باکتری ها این فرصت را پیدا می کنند تا دوباره به سطح زمین بر گردند و در مناطق بیشتری گسترده تر بشوند و این چرخه بارها تکرار می شود.اکثر باران ها و برف با شروع تشکیل یخ در ابرها شروع می شوند.
تهیه کننده : سعید کارگر🌺
🌺🌻🌹
https://telegram.me/biotechnology1
🌺🌻🌹
🌹🌺🌻نقش باکتری های مولد هسته یخ در باران سازی
وقتی باکتری های یخ ساز بر سطح گیاهان کلونی تشکیل می دهند ، وزش باد موجب می شود تا این باکتری وارد اتمسفر شوند ، زمانی که این باکتری ها وارد ابرها بشوند ، کریستال های یخ اطراف آن ها تشکیل می شود سپس سایر مولکول های بخار آب به این کریستال یخ متصل می شود و باعث می شود که این کریستال ها بزرگ تر و بزرگ تر بشود تا در نهایت کریستال های یخ تشکیل می شود که به صورت باران یا برف به سطح زمین می بارد. وقتی که این رسوب رخ دهد باکتری ها این فرصت را پیدا می کنند تا دوباره به سطح زمین بر گردند و در مناطق بیشتری گسترده تر بشوند و این چرخه بارها تکرار می شود.اکثر باران ها و برف با شروع تشکیل یخ در ابرها شروع می شوند.
تهیه کننده : سعید کارگر🌺