Специалисты МГНЦ завершили совместную работу по исследованию вариантов в гене DEPDC5

💠Специалисты Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова завершили совместную работу по исследованию вариантов в гене DEPDC5. Статья, в которой авторы подробно описали суть и результаты работы, опубликована в научном журнале Epilepsia.

💠Как рассказал заведующий отделом функциональной геномики МГНЦ, доцент кафедры молекулярной генетики и биоинформатики ИВиДПО МГНЦ, к.б.н. Михаил Скоблов, это исследование направлено на изучение роли сплайсинговых вариантов в гене DEPDC5, который обычно ассоциируется с семейными фокальными эпилепсиями.

«Герминальные гетерозиготные варианты в генах, кодирующих компоненты комплекса GATOR1 (DEPDC5, NPRL2 и NPRL3), часто выявляются при ДНК-диагностике у пациентов с эпилепсией. Однако сплайсинговые варианты в этих генах остаются малоизученными. В данной работе мы провели системный анализ как интронных, так и экзонных сплайсинговых вариантов и разработали потенциальную стратегию для коррекции патологических последствий таких вариантов»,

- пояснил эксперт.

💠Было проведено клиническое и молекулярное исследование российских пациентов из четырех семей, у которых были найдены интронные и экзонные варианты в гене DEPDC5. Для изучения патогенности вариантов были проведены функциональные исследования на крови и фибробластах пациентов, которые показали различные механизмы влияния вариантов на сплайсинг и доказали их патогенность.

💠Также ученые провели анализ опубликованных вариантов гена DEPDC5, и обнаружили, что около 14% всех вариантов в этом гене могут влиять на сплайсинг согласно предсказаниям SpliceAI. Такая оценка была проведена впервые в мире.

Мутации, иммунитет и эволюция опухоли


🔵Как генетика меняет лечение рака
Понимание молекулярных механизмов развития болезни на уровне ДНК создает новые перспективы для лечения.

🔵Секвенирование нового поколения (NGS) становится рутинным методом диагностики. Благодаря ему накапливается все больше данных о геноме опухолей.

🔵На вопросы «Ъ-Науки» о природе онкологических заболеваний, подходах в диагностике и терапии ответил заведующий кафедрой онкогенетики Института высшего и дополнительного профессионального образования Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова, ведущий научный сотрудник лаборатории эпигенетики МГНЦ, к.м.н., доцент Дмитрий Михайленко.

Сотрудники МГНЦ описали комплексный подход к диагностике первичной цилиарной дискинезии, обусловленной патогенным вариантом в гене CFAP300

💠Результаты совместной работы сотрудников лаборатории редактирования генома, научно-клинического отдела муковисцидоза, ЦКП «Геном», лаборатории генетики нарушений репродукции и лаборатории молекулярной биологии опубликованы в журнале International Journal of Molecular Sciences (Q1, импакт-фактор 4,9).

💠Первичная цилиарная дискинезия (ПЦД) – генетически гетерогенное заболевание, характеризующееся нарушением мукоцилиарного клиренса вследствие дефектов подвижных ресничек.

💠В исследовании было изучено влияние мутаций с потерей функции в гене CFAP300 на структуру и функцию ресничек у трёх пациентов с ПЦД. В работе были объединены молекулярно-генетическое тестирование, трансмиссионная электронная микроскопия, высокоскоростная видеомикроскопия и иммунофлуоресцентное окрашивание для анализа подвижности ресничек и экспрессии белков в реснитчатых клетках, полученных как ex vivo, так и in vitro.

Специалисты МГНЦ скорректировали пороговые значения TREC для выявления первичных иммунодефицитов при неонатальном скрининге

💠В Медико-генетическом научном центре имени академика Н.П. Бочкова совместно с коллегами из НМИЦ детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева провели ретроспективное исследование результатов пилотного проекта по скринингу новорожденных, который проходил в 8 регионах России в 2022 году, и уточнили пороговые значения TREC для более эффективного выявления различных первичных иммунодефицитных состояний. Статья опубликована в журнале Journal of Clinical Laboratory Analysis.

💠В проведенном исследовании работа была сосредоточена на анализе данных пациентов с низким уровнем TREC. Для определения оптимального порогового значения уровня TREC были применены статистические подходы, основанные на ROC-анализе (анализе характеристической кривой) — методе, используемом для оценки и сравнения эффективности порога значений того или иного параметра для разделения групп больных и здоровых детей.

💠ROC-анализ показал, что оптимальным пороговым значением TREC для выявления новорожденных с ПИД является 150 копий/10⁵ клеток. Значения в диапазоне 150–200 копий/10⁵ клеток указывали на новорождённых группы высокого риска, требующих более тщательного наблюдения. Определенные с использованием строгих статистических методов оптимальные пороговые значения TREC были затем протестированы на валидационной когорте детей с подтвержденным диагнозом первичного иммунодефицита, наблюдавшихся в НМИЦ детской гематологии, онкологии и иммунологии имени Дмитрия Рогачева.

💠Результаты работы найдут отражение в готовящихся методических рекомендациях по расширенному неонатальному скринингу ПИД, что повысит эффективность федеральной программы.

Заведующая лабораторией молекулярно-генетической диагностики МГНЦ Ольга Щагина приняла участие в конференции, посвященной СМА

🔹Конференция «Символ поддержки людей со СМА. Перспективы развития помощи людям со СМА в России» состоялась в Москве. Ее ключевой частью стала панельная дискуссия «Перспективы развития помощи людям со СМА в России».

🔹Эксперты обсудили различные вопросы, в том числе, расширенный неонатальный и селективный скрининги на спинально-мышечную атрофию. Врачи подчеркнули тот факт, что 3% детей со СМА имеют редкие патогенные варианты в гене SMN1, которые не обнаруживаются в рамках расширенного неонатального скрининга.

«Я призываю врачей-неврологов и педиатров не ослаблять настороженность в отношении таких редких форм СМА 5q, так как для них патогенетическая и этиотропная терапия также эффективны, как для СМА, обусловленной делецией в гене SMN1. Хорошо известно, что чем раньше установлен диагноз, тем эффективнее терапия, поэтому важно не пропустить первые симптомы, и как можно раньше направить семью на диагностику уже в рамках программ селективного скрининга»

, - отметила заведующая лабораторией молекулярно-генетической диагностики № 1 Медико-генетического научного центра имени академика Н.П. Бочкова, заведующая кафедрой молекулярной генетики и биоинформатики ИВиДПО МГНЦ, д.м.н. Ольга Щагина.

🔹Во второй части конференции прошёл финал голосования за символ поддержки людей со СМА. Победителем определен «Ландыш» – образ хрупкости и силы. Он получил более 60% голосов и стал официальным символом поддержки людей со СМА.