Метро не только главная транспортная артерия столицы, но и объект гражданской обороны. В случае чрезвычайной ситуации оно становится укрытием, как в режиме бомбоубежища, так и в случае риска химического, биологического или радиационного заражения. Люди могут размещаться на платформах станций, в поездах и в тоннелях (когда снято напряжение с контактного рельса). По оценкам сотрудников МЧС Минский метрополитен способен укрыть минимум 112 тысяч человек.
Также есть защитные сооружения на отдельных производственных объектах подземки. Они оборудованы автономными системами защиты от различных внешних неблагоприятных факторов, здесь размещены спальные места и созданы соответствующие удобства для работников.
20 и 21 октября некоторые объекты и работа соответствующих звеньев метрополитена были показаны журналистам телеканала ОНТ при непосредственном участии должностных лиц МЧС.