Telega Virus
7.76K subscribers
53 photos
23 videos
442 links
Профессиональный, но не скучный канал о микромире (бактериях, вирусах, других простейших, патогенных и не очень), который окружает человека, и о том, как выжить во власти вирусов и микробов
Download Telegram
Масс-спектрометрия выявляет изменения липидов в определенных областях мозга мышей в ответ на лечение эфавирензом
 
Группа исследователей из Мэрилендского университета решила выяснить, как лекарство влияет на организм. Эксперимент проводили на животных. Результаты опубликованы в журнале ACS Pharmacology & Translational Science.
 
Эфавиренз (EFV) связан с аномальными уровнями липидов в плазме, может приводить к изменениям в пространственной локализации отдельных липидных молекул в мозговой ткани.
Ученые провели исследование, в котором использовали подход к визуализации с помощью матрично-ассистированной лазерной десорбции/ионизационной масс-спектрометрии для определения изменений липидов в определенных областях мозга мышей после лечения EFV.
 
Были обнаружены уникальные пространственные паттерны локализации молекул фосфатидилхолина (PC), сфингомиелина (SM), церамидфосфоинозитола (PI-Cer) и гексозилцерамида (HexCer) в мозге мышей. Интересно, что PC(32:0), PC(38:5) и SM(36:1;O2) показали высокую распространенность в области гиппокампа, тогда как PI-Cer(38:8) показал низкую распространенность в области гиппокампа мозга мышей, обработанных EFV. Кроме того, ученые наблюдали низкую распространенность PC(38:6), PC(40:6) и PI-Cer(40:3) в области таламуса мозга мышей, обработанных EFV. Кроме того, SM(40:1;O2), SM(42:2;O2), SM(42:1;O2), SM(43:2;O2) и SM(43:1;O2) показали свое накопление в области мозолистого тела мозга мышей, обработанных EFV, по сравнению с контрольной группой. Однако HexCer(42:1;O3) показал истощение в области мозолистого тела в ответ на лечение EFV. Для характеристики паттернов экспрессии белков, включая ферменты метаболизма липидов, в ответ на лечение EFV, была использована протеомика на основе масс-спектрометрии.
 
Из этого следует, что уровни экспрессии 12 мозговых белков значительно снизились после лечения EFV. В совокупности эти данные дают важную информацию о влиянии EFV на метаболизм липидов мозга.

https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsptsci.4c00228
Двойная блокада ИЛ-10 и PD-1 приводит к контролю над рецидивом вируса SIV после прекращения противовирусного лечения.

Ученые добились распада вирусных резервуаров ВИЧ с помощью новой методики. Исследования проводили на приматах, результаты опубликованы в журнале Nature Immunology.

Устойчивость вируса иммунодефицита человека (ВИЧ) во время антиретровирусной терапии (АРТ) связана с повышенным уровнем интерлейкина-10 (ИЛ-10) в плазме и экспрессией PD-1. Ученые предположили, что блокада ИЛ-10 и PD-1 приведет к контролю вирусного рикошета после аналитического прерывания лечения.

В исследовании участвовал 28 макак, инфицированных вирусом иммунодефицита обезьян (SIV), проходивших АРТ. В качестве лечения проводилась иимунотерапия. Макаки были разделены на три группы: 1- группа лечилась анти-ИЛ-10; 2 группа – лечение проводилось комбинацией анти-ИЛ-10 и анти-PD-1; 3 группа-плацебо. АРТ прерывали через 12 недель после начала иммунотерапии. Длительный контроль вирусного рикошета наблюдался у девяти из десяти РМ, проходивших комбинированное лечение (2 группа), в течение >24 недель после аналитического прерывания лечения.

Индукция воспалительных цитокинов, пролиферация эффекторных CD8 + T-клеток в лимфатических узлах и снижение экспрессии BCL-2 в CD4 + T-клетках до аналитического прерывания лечения предсказывали контроль вирусного отскока. Через 24 недели  более низкая вирусная нагрузка была связана с более высокой частотой Т-клеток памяти, экспрессирующих TCF-1, и SIV-специфических CD4 + и CD8 + T-клеток в крови и лимфатических узлах макак, получавших комбинированное лечение. Эти результаты отображают путь к достижению длительного контроля ВИЧ и/или SIV после прекращения АРТ.

https://www.nature.com/articles/s41590-024-01952-4
Оценка свободных легких цепей в моче как маркера тяжести заболевания ВИЧ и их корреляция с количеством CD4

Группа ученых из Индии провела пилотное исследование с целью оценки уровней иммуноглобулинов в моче у пациентов с ВИЧ.  Работа опубликована в журнале AIDS Research and Human Retroviruses.  

Мониторинг иммунного статуса пациента стал важным аспектом оценки прогрессирования заболевания и информирования о последующем наблюдении после лечения. Оценка количества CD4 является довольно дорогостоящей и требует опыта в проточной цитометрии. При некоторых патологиях свободные легкие цепи (СЛЦ) секретируются в сыворотке и моче, и величина может использоваться для мониторинга тяжести, прогрессирования и терапевтического мониторинга заболевания. Моча в качестве образца оказывается экономически эффективной и представляет меньшие риски во время сбора образцов. Стабильность легких цепей в моче при комнатной температуре в течение длительных периодов времени также упрощает управление транспортировкой образцов.

Было проведено пилотное исследование для оценки уровней иммуноглобулинов в моче у пациентов с ВИЧ. В исследование были включены 69  пациентов с ВИЧ, не получавших АРТ, в возрасте от 18 до 40 лет и 69 здоровых контрольных лиц соответствующего возраста и пола. Мочевые свободные легкие цепи каппа (κ) и лямбда (λ) измерялись с помощью набора для иммуноглобулинов ELISA. Исходные уровни легкой цепи κ в моче были значительно выше в случаях по сравнению с контрольной группой и, как было обнаружено, увеличивались с увеличением иммунологических классов, и были обратно пропорциональны количеству клеток CD4. Не было обнаружено существенной разницы в среднем уровне легкой цепи иммуноглобулина λ в моче между случаями и контрольной группой, и не наблюдалось никакой корреляции с количеством клеток CD4 или со стадиями иммунологической классификации ВОЗ заболевания ВИЧ.

Предполагается, что измерения свободной цепи κ в моче в сочетании с измерениями легкой цепи в сыворотке могут быть полезным маркером при последующем наблюдении и мониторинге ответа на терапию у пациентов с ВИЧ, у которых тестирование с помощью проточной цитометрии недоступно.

https://www.liebertpub.com/doi/10.1089/aid.2023.0100
Найдена новая бактерия, вызывающая иммунодефицит кишечника

Ученые из клиники Кливленда (США) в составе научного коллектива установили, что бактерия Tomasiella immunophila ослабляет иммунную систему кишечника, потенциально способствуя возникновению некоторых воспалительных и инфекционных заболеваний кишечника. Результаты исследования опубликованы в журнале Science.
 
Ученые объяснили, что воспалительные заболевания кишечника, такие как болезнь Крона и язвенный колит, связаны со снижением уровня секреторного иммуноглобулина А (SIgA). Это антитело, которое защищает поверхности слизистых оболочек. В кишечнике SIgA непрерывно связывается с микробами, препятствуя их прикреплению и вторжению в эпителий хозяина.

Однако некоторые кишечные бактерии могут снижать уровень SIgA, что, в свою очередь, приводит к повышенному риску инфекции и запуску процесса воспаления. Одной из таких бактерий выступает T. immunityphila (Tomasiella immunophila). По словам исследователей, этот микроорганизм замедляет восстановление защитного барьера кишечника и увеличивает восприимчивость к патогенам.

По словам ученых, обнаружение «виновника» нарушения защитного адаптивного иммунного барьера кишечника поможет создать новые методы лечения болезни Крона и язвенного колита. Исследователи предположили, что в основе такой терапии будет лежать управление SIgA.
 
https://www.science.org/doi/10.1126/science.adk2536
Безопасность и противовирусный эффект тройной комбинации антител широкого спектра действия, нейтрализующих ВИЧ-1
 
Широко нейтрализующие моноклональные антитела (bNAbs) против вируса иммунодефицита человека типа 1 (ВИЧ-1) на сегодняшний день продемонстрировали временное подавление вируса при введении в качестве монотерапии или в виде коктейля из двух антител. Комбинация трех bNAbs обеспечивает улучшенный охват нейтрализации глобальных вирусов, что может более эффективно подавлять ускользание вируса и его повторное высвобождение. Исследование опубликовано в журнале Nature medicine.
 
Было проведено исследование, оценивающее однократную внутривенную дозу  антител bNAbs, PGT121, PGDM1400 и VRC07-523LS, у шести взрослых без ВИЧ в части 1 и многоцентровое исследование до шести ежемесячных инфузий этих трех антител bNAbs у 12 людей, живущих с ВИЧ, с перерывом в антиретровирусной терапии (АРТ) в части 2.

Первичными конечными точками были безопасность, переносимость и фармакокинетика, а вторичными конечными точками в части 2 были противовирусная активность после прекращения АРТ, изменения количества CD4 + T-клеток и развитие мутаций последовательности ВИЧ-1, связанных с резистентностью к bNAb. Испытание достигло своих заранее определенных конечных точек. Лечение bNAb в целом было безопасным и хорошо переносимым. В части 2 83% участников (10 из 12) поддерживали вирусологическое подавление в течение всего периода терапии антителами в течение как минимум 28 недель, а 42% участников (5 из 12) показали вирусологическое подавление в течение как минимум 38–44 недель, несмотря на снижение концентрации bNAb в сыворотке до низких или неопределяемых уровней.

Ранний вирусный ответ у двух человек коррелировал с базовой резистентностью к PGT121 и PGDM1400, тогда как долгосрочный вирусологический контроль у пяти человек коррелировал со сниженной иммунной активацией, истощением Т-клеток и провоспалительной активностью после терапии bNAb.

Данные исследователей показывают потенциал тройного коктейля bNAb для подавления ВИЧ-1 при отсутствии АРТ.
 
https://www.nature.com/articles/s41591-024-03247-5
Ученые Университета «Сириус» запатентовали мРНК-вакцину от туберкулеза
 
Исследователи Научно-технологического университета «Сириус»запатентовали мультиэпитопную мРНК-вакцину от туберкулеза. Ее разработка важна в первую очередь для ревакцинации взрослых, у которых единственная одобренная вакцина для профилактики туберкулеза — БЦЖ — не обеспечивает полную защиту против наиболее распространенной формы этого заболевания — туберкулеза легких. Кроме того, из-за множественной лекарственной устойчивости вызывающих болезнь штаммов Mycobacterium tuberculosis, все сложнее подобрать лечение. На данный момент эффективность нового препарата подтвердили на мышах. Теперь ученые подали заявку на проведение клинического исследования препарата.
 
Разработка эффективной вакцины против туберкулеза в дополнении к уже существующей вакцине БЦЖ является приоритетной задачей. В мРНК вакцине использовались только последовательности отсутствующие в БЦЖ, что делает ее привлекательной в качестве бустерной (повторной) прививки во взрослом возрасте.
 
При работе с мРНК-вакцинами чрезвычайную роль играет выбор антигена. В исследовании был применен новый подход, основанный на включении не всей белковой последовательности антигена, а его отдельных эпитопов. Использование иммунобиоинформатического анализа при отборе эпитопов обеспечивает высокую иммуногенность и лучшую биобезопасность будущей мРНК вакцины. В качестве антигена ученые создали полипептид из пяти фрагментов белка ESAT-6 бактерии, вызывающей туберкулез — Mycobacterium tuberculosis. Для доставки мРНК в клетки используются липидные наночастицы.
 
Проверка эффективности вакцины на лабораторных животных показала формирование устойчивого специфического Т-клеточного и гуморального иммунного ответа против возбудителя туберкулеза.

https://www1.fips.ru/registers-doc-view/fips_servlet?DB=RUPAT&DocNumber=2824195&TypeFile=html
Влияние тенофовира алафенамида фумарата на липидный профиль сыворотки у пациентов с хроническим гепатитом В

Исследователи из Китая оценили влияние лечения тенофовиром алафенамидом фумаратом (TAF) на липидный профиль пациентов с хроническим гепатитом В (ХГВ). Результаты работы опубликованы в в Virology Journal.
 
В исследование ретроспективно были включены 430 пациентов с ХГВ из трех больниц, в том числе 158 пациентов, получавших лечение ТАF, и 272 пациента, получавших лечение тенофовира дизопроксила фумаратом (ТDF).
 
Критерии включения были следующими: возраст ≥ 18 лет; терапия TAF или TDF в течение не менее 3 месяцев; уровни триглицеридов и общего холестерина в пределах нормы до начала лечения. Критерии исключения были следующими: сопутствующая ГЦК или другие злокачественные новообразования; коинфекция вирусом гепатита С, вирусом гепатита D или вирусом иммунодефицита человека; сопутствующие заболевания печени, такие как алкогольная болезнь печени, жировая дистрофия печени (диагностируется с помощью УЗИ) и аутоиммунные заболевания печени; беременность на момент включения в исследование; пациенты, принимающие препараты, снижающие уровень липидов, гормоны или иммунодепрессанты.
 
В этой многоцентровой когорте кумулятивная частота дислипидемии была заметно выше в группе TAF, чем в группе TDF. После лечения TAF наблюдалось значительное повышение уровня триглицеридов (ТГ) (с 0,83 ммоль/л до 1,02 ммоль/л) и общего холестерина (ОХ) (с 4,16 ммоль/л до 4,32 ммоль/л). Аналогичные изменения уровней ТГ и ОХ наблюдались в группе TAF после сопоставления баллов предрасположенности (PSM). Уровни ТГ (с 0,83 ммоль/л до 1,04 ммоль/л) и уровни ОХС (с 4,16 ммоль/л до 4,38 ммоль/л) были значительно повышены по сравнению с исходными уровнями в когорте PSM пациентов, получавших лечение TAF. Напротив, во время лечения TDF не наблюдалось существенного влияния на уровни TГ, в то время как уровни ОХ показали тенденцию к снижению.
 
TDF и TAF, как мощные нуклеозидный аналоги с высоким барьером резистентности, рекомендуются в качестве препаратов первой линии для лечения хронической инфекции HBV. TAF демонстрирует сопоставимую противовирусную эффективность с TDF, в то время как TAF имеет лучший профиль безопасности для костей и почек, чем TDF.
 
По сравнению с лечением TDF, лечение TAF было связано с дислипидемией у пациентов с ХГВ. В с связи необходим тщательный мониторинг липидного профиля у пациентов с ХГВ, получавших лечение TAF.
 
https://virologyj.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12985-024-02515-7
Тревожные расстройства и их связь с подавлением вирусной нагрузки среди лиц с ВИЧ
 
Эксперты из Университета Джонса Хопкинса решили выяснить связано ли лечение тревожности  с уменьшением вирусной нагрузки у лиц с ВИЧ. Результаты работы опубликованы в журнале AIDS.

В исследовании участвовали 1967 человек, которые получали лечение от ВИЧ. Наблюдение длилось с 2014 по 2023 года. В течение этого времени пациенты несколько раз заполняли специальные опросники, в которых рассказывали о своем состоянии.

Почти 1 из 5 пациентов сообщили о симптомах тревоги легкой или тяжелой степени, но в настоящее время не получали психиатрической помощи или фармакологического лечения тревоги; 6% пациентов сообщили о симптомах тревоги, но получали лечение, а 7% лечились от тревоги, которая в настоящее время находилась в стадии ремиссии. За весь период исследования у 28% участников диагностировали тревожное расстройство, а у 54% — депрессию.

Эксперты пришли к выводу, что показатели вирусной супрессии (когда вирусная нагрузка менее 200 копий) были схожи у участников без тревожности и тех, кто лечил тревогу (87- 89%). Люди с нелеченной умеренной и тяжелой тревогой, реже имели подавленную вирусную нагрузку — 81%. Нелеченая умеренно-тяжелая тревога оставалась связанной с отсутствием подавления вируса в демографических группах.
 
Ученые наблюдали прочную связь между нелеченной тревожностью и вирусной нагрузкой в большой городской когорте людей с ВИЧ. Скрининг на тревожность может выявить пациентов с неудовлетворенными потребностями в психиатрической помощи, которые сталкиваются с препятствиями для поддержания вирусной супрессии.
 
https://journals.lww.com/aidsonline/abstract/9900/the_anxiety_care_continuum_and_its_association.533.aspx
Найдено природное соединение, защищающее от туберкулеза
 
Ученые из Университета Британской Колумбии обнаружили, что соединение растительного происхождения под названием BPD-9 может эффективно уничтожать возбудителей туберкулеза у людей. Результаты исследования опубликованы в Applied and Environmental Microbiology (АЕМ).
 
Mycobacterium tuberculosis представляет собой микобактерию, ответственную за развитие туберкулезной инфекции. Она обладает сложной структурой клеточной стенки, которая обеспечивает ей стойкость к кислотам, щелочам, спирту и различным химическим веществам. Существующие протоколы антибиотикотерапии для борьбы с туберкулезом также требуют постоянного пересмотра, так как M. tuberculosis быстро вырабатывает устойчивость к используемым медикаментам.
 
В ходе исследования ученые искали новые антибиотические препараты против M. tuberculosis, которые бы действовали даже на лекарственно-устойчивые штаммы. Их внимание привлек сангвинарин — природное соединение с антимикробными свойствами, извлекаемое из цветущего растения, произрастающего в Северной Америке.
 
Ранее сангвинарин использовали для лечения животных, но для человека он оказался высокотоксичным. С применением принципов медицинской химии, исследователи разработали более безопасное антибактериальное соединение на основе сангвинарина.
Новая версия сангвинарина, получившая название BPD-9, продемонстрировала способность уничтожать штаммы M. tuberculosis, устойчивые ко всем антибиотикам первой линии. Также BPD-9 был эффективен против нереплицирующихся и внутриклеточных форм бактерий. BPD-9 активен исключительно против патогенных микобактерий из рода M. tuberculosis и не нарушает человеческий микробиом. По словам ученых, такое свойство может сделать его полезным в борьбе с другими микобактериями, вызывающими тяжелые легочные инфекции.
 
https://journals.asm.org/journal/aem
Последствия низкого уровня виремии среди женщин с ВИЧ в США
 
Ученые изучали низкий уровень виреми и потенциальные клинические последствия, такие как вирусологическая неудача и развитие сопутствующих заболеваний, не связанных со СПИДом, среди женщин, живущих с ВИЧ. Работа опубликована в журнале AIDS.
 
Исследование продолжалось с 2003 по 2020 год среди женщин в США, которые получали антиретровирусную терапию (любой трехкомпанентный режим) в течение не менее 1 года с последующим уровнем вирусной нагрузки ВИЧ-1 менее 200 копий/мл. Последовательные измерения вирусной нагрузки в ходе четырех полугодовых визитов использовались для классификации женщин на исходном уровне как имеющих: вирусологическое подавление (вся вирусная нагрузка неопределяема), прерывистый низкий уровень виремии (непоследовательная определяемая вирусная нагрузка до 199 копий/мл), постоянный низкий уровень виремии (по крайней мере две последовательные определяемые вирусные нагрузки до 199 копий/мл) или вирусологическая неудача (любая вирусная нагрузка ≥200 копий/мл). Мультиморбидность определялась как не менее двух из пяти общих оцененных признаков, таких как: гипертония, дислипидемия, сахарный диабет, сердечно-сосудистое заболевание или заболевание почек.
 
Из 1598 обследуемых женщин с ВИЧ, средний возраст составил 47 лет, а среднее количество клеток CD4 + составило 621 клеток/мкл. После исключения 275 женщин (17%), у которых на исходном уровне была вирусологическая неудача, 58% были отнесены к категории имеющих вирусологическую супрессию,19% к группе с прерывистый низким уровнем виремии и 6% с постоянным низким уровнем виремии соответственно. 543 из 1598 (34%) женщины имели мультиморбидность на исходном уровне, представленную следующим распределением: 231 женщина с ВИЧ (43%) с диабетом, 510 (94%) с гипертонией, 365 (67%) с гиперлипидемией, 145 (27%) с заболеванием почек и 179 (33%) с сердечно-сосудистыми заболеваниями.  Риск мультиморбидности произошел среди 154 из 780 (20%) в целом, что составляет 107 (20%) женщин с вирусологической супрессией, 32 (18%) с женщины с прерывистым низким уровнеми 15 (27%) с постоянным низким уровнем виремии на исходном уровне. 
 
Женщины с прерывистым низким уровнем виремии и постоянным низким уровнем виремии имели повышенный риск вирусологической неудачи. Женщины с постоянным низким уровнем виремии имели тенденцию к повышенному риску мультиморбидности.
 
https://journals.lww.com/aidsonline/fulltext/2024/11010/consequences_of_low_level_viremia_among_women_with.4.aspx
Восприимчивость к ленакапавиру, фостемсавиру и широко нейтрализующим антителам у французских пациентов с первичной  ВИЧ-1 инфекцией

Группа ученых изучала закономерности резистентности к традиционным классам АРТ — НИОТ, ННИОТ, ингибиторам протеазы (ИП) и ингибиторам переноса цепи интегразы (ИНИ), — а также к новым методам лечения, таким как ингибитор капсида (КА) ленакапавир и ингибиторы проникновения, включая маравирок, фостемсавир и широко распространенные моноклональное антитела bNAb, такие как зинлирвимаб и теропавимаб, среди ЛЖВ, диагностированных в период с 2020 по 2023 год на момент первичной инфекции ВИЧ-1. Работа опубликована  Journal of Medical Virologу.

Исследования по наблюдению за передаваемой лекарственной устойчивостью (TDR) имеют решающее значение для отслеживания эволюции эпидемиологии ВИЧ. Целью было изучить TDR к нуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы (НИОТ), ненуклеозидным ингибиторам обратной транскриптазы (ННИОТ), ингибиторам протеазы (ИП), ингибиторам переноса цепи интегразы (ИНИ), а также к новым препаратам: ленакапавиру, фостемсавиру. Прогностическая чувствительность была оценена для маравирока и широко нейтрализующих антител (bNAbs) - зинлирвимаба и теропавимаба.
 
В период с 2020 по 2023 год у 85 человек была диагностирована первичная инфекция ВИЧ-1. Последовательности Pol и env были проанализированы, а TDR была охарактеризована в соответствии с французским алгоритмом ANRS. Генотипическое прогнозирование чувствительности bNAbs основывалось на аминокислотных сигнатурах I108, I201, F353 env HIV для теропавимаба и N325, N332, H330 для зинлирвимаба. Передаваемая лекарственная устойчивость (TDR) к НИОТ, ННИОТ, ИП и ИНИ была подтверждена у 8,2%, 12,9%, 4,7% и 5,9% штаммов соответственно. 10 вирусов представляли собой смесь CXCR4/dual. Все вирусы были восприимчивы к ленакапавиру (100%), а 52% имели устойчивость к фостемсавиру. Генотипический профиль был связан с прогностической положительной ценностью (PPV) > 83% восприимчивости как к теропавимабу, так и к зинлирвимабу для 23 вирусов (31%), в то время как 22 (29%) имели PPV между 62% и 75%, что предполагает сниженную восприимчивость к обоим bNAbs сразу после первичной инфекции.
 
Наблюдение за TDR, подтвержденное во время первичной инфекции ВИЧ-1, важно в отношении новых стратегий для пациентов с ВИЧ с вирусологической неудачей и глобального внедрения PrEP с использованием НИОТ, ИНИ, таких как недавно одобренный инъекционный каботегравир, и будущих препаратов длительного действия, таких как ленакапавир и bNAbs.
 
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.29948
Скрининг восприимчивости вирусов ВИЧ-1 к широко нейтрализующим антителам, теропавимабу и зинлирвимабу, у людей с ВИЧ-1, подавленным антиретровирусной терапией
 
Разнообразие оболочки ВИЧ (env) может привести к резистентности к широко нейтрализующим антителам (bNAbs). Оценка генотипической или фенотипической восприимчивости к антиретровирусному лечению часто проводится у людей с ВИЧ-1 и используется для скрининга клинических испытаний на восприимчивость к bNAb ВИЧ-1. Оптимальные методы скрининга восприимчивости к bNAb пока не ясны. Работа опубликована в  Journal of acquired immune deficiency syndromes (JAIDS).

Фенотипический и генотипический анализы были проведены на 124 образцах скрининга для теропавимаба и зинлирвимаба, вводимых с ленакапавиром у людей с ВИЧ с подавленной вирусной активностью. Фенотипический анализ был проведен на интегрированном провирусе ВИЧ-1 и стимулированном вирусе роста, с восприимчивостью к bNAbs, определенной как 90% ингибирующая концентрация ≤2 мкг/мл. Ген провирусной ДНК ВИЧ env был генотипирован с использованием глубокого секвенирования, а восприимчивость bNAb прогнозировалась с использованием опубликованных сигнатур аминокислот env.

Результаты провирусного фенотипирования были представлены для 109 из 124 образцов; 75% (82/109) были восприимчивы к теропавимабу, 65% (71/109) к зинлирвимабу и 50% (55/109) к обоим bNAbs. Фенотипическая восприимчивость вирусов роста была доступна для 39 образцов; 56% (22/39) были восприимчивы к теропавимабу и 64% (25/39) к зинлирвимабу. Фенотипическая восприимчивость коррелировала между этими методами: теропавимаб r = 0,82 (P < 0,0001); зинлирвимаб r = 0,77 (P < 0,0001). Шестьдесят семь образцов имели генотипические и фенотипические данные. Провирусные генотипические сигнатуры предсказывали провирусную фенотипическую восприимчивость с высокой положительной прогностической ценностью (68–86% теропавимаб; 63–90% зинлирвимаб).

Восприимчивость к bNAb коррелировала между всеми тремя анализами in-vitro, используемыми для определения восприимчивости к теропавимабу и зинлирвимабу у людей с ВИЧ с подавленной вирусной нагрузкой.
 
https://journals.lww.com/jaids/abstract/9900/susceptibility_screening_of_hiv_1_viruses_to.509.aspx
Исследование: безопасна ли трансплантации почек от доноров с ВИЧ?

Данной проблемой заинтересовались ученые из Университета Джонса Хопкинса. Работа опубликована в The New England Journal of Medicine.

Трансплантация почек от доноров с вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ) реципиентам с ВИЧ — это новая практика. Она проводится с 2016 года в соответствии с Законом Конгресса США о справедливости политики в отношении органов при ВИЧ и в настоящее время одобрена только для исследовательских целей.

Было зарегистрировано 408 кандидатов на трансплантацию, из которых 198 получили почку от умершего донора; 99 получили почку от донора с ВИЧ и 99 от донора без ВИЧ. Скорректированное отношение рисков для составного первичного результата составило 1,00, что показало не меньшую эффективность.

Следующие вторичные результаты были схожи, независимо от того, был ли донор с ВИЧ или нет: общая выживаемость через 1 год (94% против 95%) и через 3 года (85% против 87%), выживаемость без потери трансплантата через 1 год (93% против 90%) и через 3 года (84% против 81%) и отторжение через 1 год (13% против 21%) и через 3 года (21% против 24%). Частота серьезных нежелательных явлений таких как: инфекций, хирургических или сосудистых осложнений и рака была схожей в группах.

У большей части людей после пересадки сохранялась вирусная супрессия. У 13 человек, которым пересадили почки от ЛЖВ, показатели ВИЧ в крови резко возросли. В группе «отрицательных доноров» было четыре таких случая — эксперты связывают это с нарушением режима лечения.

В этом исследовании трансплантация от доноров с ВИЧ оказалась не менее эффективной, чем от доноров без ВИЧ.

https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2403733
Ядерный фактор kappa B p65: возможный биомаркер стойкого воспаления при инфекции ВИЧ-1

У людей, живущих с ВИЧ, наблюдается постоянная активация иммунной системы и воспаление даже при подавлении вируса, что приводит к развитию таких состояний, как сердечно-сосудистые заболевания, нейрокогнитивные расстройства и другие заболевания, не связанные со СПИДом. Ученые обнаружили ядерный факторный белок, который участвует в модуляции иммунных реакций. Результаты работы опубликованы в журнале Cureus.

Ученые из США обнаружили биомаркер стойкого воспаления у людей, живущих с ВИЧ, – это ядерный факторный белок NF-kappa B p65 (NF-κB p65). Он также участвует в иммунной защите организма, что позволяет ему координировать ответ на различные инфекции и другие угрозы посредством регуляции генов.

Исследования показали, что даже у людей с подавленной вирусной нагрузкой наличие ДНК ВИЧ в резервуарах может вызывать активацию иммунной системы и воспаление через путь NF-κB, что приводит к нейрокогнитивным расстройствам, связанным с ВИЧ. Микробная транслокация кишечника: дисбактериоз кишечника изучался у ВИЧ-инфицированных людей, получающих эффективную АРТ, где нарушения нормальной микробной флоры кишечника приводят к повреждению кишечника. Это состояние позволяет бактериальным продуктам, таким как липополисахариды (ЛПС), попадать в системный кровоток, вызывая воспаление и активацию иммунной системы, что, в свою очередь, увеличивает риск неинфекционных заболеваний. Циркулирующий ЛПС может активировать NF-κB p65, что способствует как активации иммунной системы, так и, потенциально, репликации вируса. У пациентов с ВИЧ могут наблюдаться сопутствующие инфекции с другими патогенами, включая вирусы гепатита, цитомегаловирус (ЦМВ), вирус Эпштейна-Барр или туберкулез. Каждая из этих сопутствующих инфекций может независимо вызывать активацию иммунной системы и воспаление за счет активации NF-kB p65, которая играет центральную роль в воспалительном ответе. Эти сопутствующие инфекции усложняют разделение активации иммунной системы, вызванной ВИЧ, и устойчивой активации иммунной системы после АРТ, что затрудняет устранение воспаления.

ВИЧ-инфицированные люди испытывают постоянную иммунную дисфункцию, включая изменение в субпопуляциях Т-клеток, увеличение количества более стареющих Т-клеток и постоянную активацию моноцитов и макрофагов. Однако эти изменения не могут быть полностью обращены вспять даже при АРТ, что приводит к устойчивой иммунной активации и воспалению.

Маркеры иммунной активации, такие как CD38 и HLA-DR на Т-клетках, остаются повышенными у лиц, проходящих АРТ, по сравнению с неинфицированными контрольными лицами. Продукция воспалительных цитокинов: осложнения, связанные с хронической ВИЧ-инфекцией, включают увеличение провоспалительных цитокинов, включая IL-6, TNF-α и IL-1β, что способствует таким сопутствующим заболеваниям, связанным с ВИЧ, как сердечно-сосудистые заболевания.

Даже при АРТ воспаление все еще присутствует, поскольку уровни цитокинов остаются высокими. Влияние АРТ стало очевидным, однако АРТ не смогла восстановить активность NF-kB, а также уровни цитокинов, что помогает объяснить постоянное воспаление у людей, живущих с ВИЧ.

Таким образом, NF-κB p65 не только участвует в репликации или реактивации ВИЧ, но также отвечает за высвобождение воспалительных цитокинов бактериальными продуктами, дисбактериоз кишечника, коинфекцию и нарушения иммунной регуляции даже при неэффективной АРТ.

Взаимодействие между ВИЧ-1 и NF-κB p65 не ограничивается репликацией вируса, но имеет и другое значение. Активация NF-κB p65 приводит к устойчивой иммунной стимуляции и воспалению даже у пациентов с подавляющей АРТ и неопределяемой вирусной нагрузкой ВИЧ. Из-за устойчивой активации NF-κB p65 воспаление, которое, как известно, вызывает ВИЧ, сохраняется и, следовательно, приводит к ряду осложнений, включая сердечно-сосудистые заболевания и нейрокогнитивные расстройства среди прочих. Эти состояния усложняют общий контроль и лечение ВИЧ в долгосрочной перспективе, несмотря на оптимальное подавление вируса.

https://www.cureus.com/articles/30205
Реакция на вакцину и иммунный ответ у людей, живущих с ВИЧ, после перенесенной Covid-19

Исследователи в своей статье в журнале Npj Vaccines показали сильный Т-клеточный иммунитет после вакцинации от COVID-19 мРНК-вакциной, что демонстрирует способность хорошего вакцинного иммунитета даже у ЛЖВ с низким количеством CD4, несмотря на низкие серологические ответы.

Пандемия COVID-19 создала проблему для людей, живущих с ВИЧ, особенно для лиц с невосприимчивостью к иммунной системе с нарушенным восстановлением Т-клеток CD4 после антиретровирусной терапии (количество CD4 <350 клеток). Их сниженный ответ на вакцину вызвал опасения относительно их уязвимости к инфекции, вызванной вирусом SARS-CoV-2.

Проведенное углубленное исследование выявило хроническое воспаление у ЛЖВ и ограниченный ответ IgG против S-белка вируса после вакцинации. Тем не менее, импринтинг В-клеток, специфичных к S-белку, путем вакцинации значительно усилил гуморальные ответы. Примечательно, что величина клеточного ответа CD4 у всех ЛЖВ была сопоставима с таковой у здоровых доноров.
Однако полифункциональность и фенотип Т-клеток CD8, специфичных к S-белку, отличались от контрольной группы.
Полученные результаты подчеркивают необходимость дополнительных ревакцинаций с использованием вариантных вакцин, а также мониторинга соблюдения АРТ и стойкости как гуморального, так и клеточного иммунитета против SARS-CoV-2.

https://www.nature.com/articles/s41541-024-00972-3
Эффективность и безопасность ленакапавира у пациентов с множественной лекарственной устойчивостью ВИЧ-1

Ученые из Йельского университета в США представили результаты исследования CAPELLA. Исследование опубликовано в журнале Clinical Infectious Diseases.

В исследование вошли 72 взрослых пациента с множественной лекарственной устойчивостью к ВИЧ-1. Наблюдение продолжалось в течение 104 недель. Пациенты получали индивидуальные фоновые схемы лечения, к которым добавлялись подкожные инъекции ленакапавира каждые 26 недель.

У 82% из 54 участников уровень РНК ВИЧ-1 был <50 копий/мл на 104-й неделе, среднее количество клеток CD4 увеличилось на 122 клетки/мкл, а доля участников с количеством клеток CD4 <200 клеток/мкл снизилась с 64% (46 из 72) на исходном уровне до 29% (16 из 55).

У 14 участников наблюдалась резистентность к ленакапавиру, возникшая во время лечения; у 7 она была повторно подавлена (РНК ВИЧ-1 <50 копий/мл) при продолжении приема ленакапавира. Не было никаких побочных эффектов 4-й степени или серьезных побочных эффектов, связанных с лечением. Один участник прекратил прием исследуемого препарата из-за реакции в месте инъекции.

Лечение подкожным ленакапавиром в сочетании с оптимизированным фоновым режимом лечения хорошо переносилось и привело к высокому уровню вирусологического подавления в течение 104 недель. Ленакапавир представляет собой важный вариант лечения для людей с множественной лекарственной устойчивостью ВИЧ-1.

https://academic.oup.com/cid/advance-article-abstract/doi/10.1093/cid/ciae423/7745000?redirectedFrom=fulltext&login=false
Комбинация ислатравира/ленакапавира один раз в неделю обеспечивает поддержание вирусной супрессии у взрослых на 48-й неделе

Gilead Science и Merck объявили результаты 2 фазы исследования экспериментальной комбинированной схемы лечения ислатравир/ленакапавир.

В исследовании приняли участие 104 взрослых пациента с ВИЧ с подавленной вирусной нагрузкой (принимающие Биктарви (биктегравир 50 мг/эмтрицитабин 200 мг/тенофовир алафенамид 25 мг таблетки, B/F/TAF). Все пациенты были случайным образом распределены в соотношении 1:1 для получения либо перорального ислатравира 2 мг и ленакапавира 300 мг один раз в неделю (n=52), либо для продолжения ежедневного перорального приема Биктарви (n=52). Средний возраст участников составил 40 лет.

Доля лиц с РНК ВИЧ-1 <50 копий/мл на 48-й неделе показала, что участники, которые перешли на лечение ислатравиром и ленакапавиром один раз в неделю (ISL + LEN) или продолжили принимать Биктарви, сохранили сравнительно высокие показатели подавления ВИЧ (94,2% против 92,3% соответственно). Ни один из участников, получавших лечение ISL + LEN или Биктарви, не имел вирусной нагрузки ≥ 50 копий/мл на 48-й неделе.

Побочные эффекты, наблюдались у 19% участников в группе ISL/LEN и у 6% в группе Биктарви. Среди них наиболее распространено были сухость во рту и тошнота.
На 48-й неделе не наблюдалось существенных различий между группами лечения в среднем изменений от исходного уровня количества CD4+ T-клеток или абсолютного количества лимфоцитов.

Новые варианты лечения ВИЧ, которые позволяют принимать пероральные препараты реже, потенциально могут помочь в соблюдении режима и устранить стигму, с которой сталкиваются некоторые люди, принимающие ежедневную пероральную терапию.

https://www.biospace.com/press-releases/gilead-and-merck-announce-phase-2-data-showing-a-treatment-switch-to-an-investigational-oral-once-weekly-combination-regimen-of-islatravir-and-lenacapavir-maintained-viral-suppression-in-adults-at-week-48
Изменение метаболизма печени и чувствительности к инсулину в ответ на туберкулез легких

Ученые пришли к выводу, что туберкулез легких приводит к изменениям метаболизма печени, вследствие снижения глюконеогенеза и системного снижения чувствительности к инсулину. Работа опубликована в журнале PLoS Pathogens.

Туберкулез легких (ТБ) запускает хроническое системное воспаление. Влияет ли воспаление, вызванное туберкулезом, на органы метаболизма и приводит ли оно к нарушению обмена веществ, неясно.

Печень является главным регулятором метаболизма. Для определения влияния туберкулеза легких на этот орган был проведен анализ мРНК и белков печени у мышей с туберкулезом и повторно проанализированы опубликованные данные о заболеваниях человека.

Туберкулез легких привел к повышению регуляции генов в печени, связанных с иммунной сигнализацией, и снижению регуляции генов, кодирующих метаболические процессы. В печени гены сигнального пути IFN были повышены, и это отразилось в увеличении биохимических доказательств сигнализации IFN, включая ядерную локализацию фосфорилированного Stat-1 в гепатоцитах. В печени также наблюдалась сниженная экспрессия генов, кодирующих ферменты, ограничивающие скорость глюконеогенеза Pck1 и G6pc. Фосфорилирование CREB, фактора транскрипции, контролирующего глюконеогенез, было резко снижено в печени мышей с легочным туберкулезом, как и фосфорилирование других киназ, связанных с метаболизмом глюкозы, включая GSK3a, AMPK и p42. В поддержку связи между повышенной регуляцией сигнала IFN и пониженной регуляцией метаболических функций в печени было обнаружено подавление экспрессии глюконеогенных генов и сниженное фосфорилирование CREB в клеточных линиях гепатоцитов, обработанных интерферонами. Влияние сниженной экспрессии глюконеогенных генов в печени было замечено, когда инфицированные мыши были менее способны преобразовывать пируват, субстрат глюконеогенеза, в той же степени, что и неинфицированные мыши. Инфицированные мыши также показали доказательства сниженной системной и печеночной чувствительности к инсулину.

Аналогичным образом, у людей с туберкулезом обнаружено, что изменения в сигнатуре резистентности к инсулину на основе метаболитов коррелируют по времени с успешным лечением активного туберкулеза и с прогрессированием в активный туберкулез после воздействия. Эти данные подтверждают гипотезу о том, что туберкулез вызывает интерферон-опосредованное изменение метаболизма печени, что приводит к снижению глюконеогенеза и системному снижению чувствительности к инсулину.

https://journals.plos.org/plospathogens/article?id=10.1371/journal.ppat.1012565
Инженерные иммуногены, которые выбирают специфические мутации в антителах, нейтрализующих ВИЧ

Открытие эффективных стратегий быстрого дизайна иммуногенов для индукции широко нейтрализующих антител ВИЧ-1 (bnAbs) имеет решающее значение для разработки вакцины против ВИЧ-1 и других высоковариабельных вирусов. Работа опубликована в журнале Nature communications.

Разработка вакцины, нацеленной на быстро эволюционирующие патогены, такие как ВИЧ-1, требует индукции широко нейтрализующих антител (bnAbs) с консервативными паратопами и мутациями, а в некоторых случаях и с теми же тяжелыми цепями Ig. Текущий поиск модификаций иммуногенов методом проб и ошибок, которые улучшают отбор для определенных мутаций bnAb, неточен. Чтобы точно спроектировать иммуногены, усиливающие bnAb, были использованы моделирование молекулярной динамики для изучения состояний встречи, которые образуются, когда антитела сталкиваются с оболочкой ВИЧ-1 (Env). Картируя, как bnAbs используют состояния встречи для поиска своих связанных состояний, ученые идентифицировали мутации Env, которые, как прогнозируется, выбирают для определенных мутаций антител в двух линиях B-клеток ВИЧ-1 bnAb. Мутации Env кодируют усиление сродства антител и выбирают желаемые мутации антител in vivo.

Эти результаты демонстрируют подтверждение концепции, что иммуногены Env могут быть разработаны для прямого отбора специфических мутаций антител с точностью на уровне остатков путем вакцинации, тем самым демонстрируя осуществимость разработки последовательной вакцины против ВИЧ-1, индуцирующей bnAb.

https://www.nature.com/articles/s41467-024-53120-9
Характеристика генома ВИЧ-ассоциированной лимфомы выявляет гетерогенность среди гистологических подтипов

Люди с ВИЧ подвергаются повышенному риску лимфомы, что делает ее важной причиной смерти среди людей с ВИЧ. Ученые из Дании охарактеризовали генетические абберации, которые лежат в основе лимфом. Работа опубликована в журнале AIDS.

Ученые провели панельное секвенирование нового поколения для изучения мутационного статуса диагностических биопсий лимфомы у 18 пациентов с диагнозом лимфома, вызванной ВИЧ-инфекцией. У 9 пациентов встречалась диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома, классическая лимфома Ходжкина у 6, лимфома Беркитта у 2 пациентов, фолликулярная лимфома у 1 пациента и лимфома маргинальной зоны у 1 пациента. Панель включала 69 лимфоидных и/или миелоидно-релевантных генов, в которых была секвенирована либо вся кодирующая последовательность, либо область горячей точки.

Среди 18 лимфом было обнаружено 213 вариантов. Количество обнаруженных мутаций варьировалось от 4 до 41 на опухоль, распределенных по 42 генам, включая как экзонные, так и интронные области. Наиболее часто мутировавшие гены включали KMT2D (67%), TNFAIP3 (50%) и TP53 (61%). Примечательно, что не было обнаружено ни одного гена, который содержал бы варианты во всех ВИЧ-ассоциированных лимфомах, и также не было найдено специфичных для подтипа вариантов. Хотя некоторые варианты были общими для пациентов, большинство были уникальными для отдельного пациента и часто не сообщались как злокачественные генетические варианты в базах данных.

Полученные результаты демонстрируют генетическую гетерогенность гистологических подтипов ВИЧ-ассоциированных лимфом и, таким образом, помогают выяснить генетические и патофизиологические механизмы, лежащие в основе заболевания.

https://journals.lww.com/aidsonline/abstract/2024/11150/characterization_of_the_genomic_landscape_of.3.aspx