Февральское обновление платформы для анализа пользовательских данных антибиотикорезистентности #AMRcloud:
🔸Добавлена возможность догружать данные в ранее созданный набор;
🔸Улучшено отображение круговых диаграмм;
🔸Добавлена возможность выбора вкладок для отображения при создании ссылок;
🔸Улучшена генерация ссылок;
🔸В раздел "Антибиотики (все)" добавлена возможность создавать стратифицированные таблицы резистентности для произвольного количества микроорганизмов;
🔸При добавлении графика в дашборд появилась возможность выбора столбцов, которые нужно игнорировать при автоматическом перерасчёте графика;
🔸Улучшена стабильность работы.
https://amrcloud.net/ru
🔸Добавлена возможность догружать данные в ранее созданный набор;
🔸Улучшено отображение круговых диаграмм;
🔸Добавлена возможность выбора вкладок для отображения при создании ссылок;
🔸Улучшена генерация ссылок;
🔸В раздел "Антибиотики (все)" добавлена возможность создавать стратифицированные таблицы резистентности для произвольного количества микроорганизмов;
🔸При добавлении графика в дашборд появилась возможность выбора столбцов, которые нужно игнорировать при автоматическом перерасчёте графика;
🔸Улучшена стабильность работы.
https://amrcloud.net/ru
🎉🎓 В НИИ АХ (Смоленск) с успехом прошёл предконференционный мастер-класс от разработчиков экосистемы AMRhub: «Антимикробная терапия и HealthTech: какие технологии нам доступны».
Кроме хорошо известных программных продуктов #AMRmap, #AMRcloud и #AMRbook на симпозиуме был впервые представлена платформа для создания, редактирования и обмена протоколами и алгоритмами терапии #AMRnote
Кроме хорошо известных программных продуктов #AMRmap, #AMRcloud и #AMRbook на симпозиуме был впервые представлена платформа для создания, редактирования и обмена протоколами и алгоритмами терапии #AMRnote
🎉 Команда разработчиков проекта #AMRhub c гордостью сообщает, что наш многолетний труд по созданию и внедрению онлайн-платформ #AMRmap и #AMRcloud признан Правительством Российской Федерации важнейшим стратегическим направлением технологического развития.
🇷🇺 8 февраля 2022 на заседании Совета при Президенте РФ по науке и образованию обсуждалась реализация инновационных проектов государственного значения:
«...В рамках данного проекта [по созданию научно-технологических основ оперативного реагирования на инфекционные заболевания] предлагается структурировать всю работу по технологическим контурам...
...Первые два контура направлены на исследование патогенов, а именно: первый контур – антигенной структуры, который посвящён разработке унифицированных методов оперативного получения новых знаний о патогене, в том числе необходимых для разработки лекарственных средств или в управлении рисками распространения заболеваний.
Второй контур – мониторинг антимикробной резистентности, включающий как федеральные, так и локальные сегменты, вплоть до отдельных медицинских организаций.
Почему это важно? Потому что антимикробные препараты часто назначаются при бактериальных осложнениях вирусных инфекций. Поэтому работа в рамках контура с применением современных информационных технологий будет направлена и на правильное назначение лекарственных препаратов, и на снижение рисков ускоренного развития устойчивости к антибиотикам в условиях эпидемии.»
Подробная стенограмма заседания: http://kremlin.ru/events/president/news/67740
🇷🇺 8 февраля 2022 на заседании Совета при Президенте РФ по науке и образованию обсуждалась реализация инновационных проектов государственного значения:
«...В рамках данного проекта [по созданию научно-технологических основ оперативного реагирования на инфекционные заболевания] предлагается структурировать всю работу по технологическим контурам...
...Первые два контура направлены на исследование патогенов, а именно: первый контур – антигенной структуры, который посвящён разработке унифицированных методов оперативного получения новых знаний о патогене, в том числе необходимых для разработки лекарственных средств или в управлении рисками распространения заболеваний.
Второй контур – мониторинг антимикробной резистентности, включающий как федеральные, так и локальные сегменты, вплоть до отдельных медицинских организаций.
Почему это важно? Потому что антимикробные препараты часто назначаются при бактериальных осложнениях вирусных инфекций. Поэтому работа в рамках контура с применением современных информационных технологий будет направлена и на правильное назначение лекарственных препаратов, и на снижение рисков ускоренного развития устойчивости к антибиотикам в условиях эпидемии.»
Подробная стенограмма заседания: http://kremlin.ru/events/president/news/67740
Президент России
Заседание Совета по науке и образованию
В День российской науки Владимир Путин в режиме видеоконференции провёл заседание Совета при Президенте Российской Федерации по науке и образованию. Основной вопрос повестки дня – реализация важнейших инновационных проектов государственного значения.
👍1
🎓 Уважаемые коллеги! В февральском обновлении платформы #AMRcloud была добавлена возможность догружать данные в ранее созданный набор, а также в раздел "Антибиотики (все)" добавлена возможность создавать стратифицированные таблицы резистентности для произвольного количества микроорганизмов.
🎥 Посмотреть на то, как это работает можно в обновлённом видеоруководстве "Работа с AMRcloud". Работа с обновлениями показана ближе к концу роликов.
https://youtu.be/vdqemjOqnMQ
https://youtu.be/zjI-k6lSM4Q
🎥 Посмотреть на то, как это работает можно в обновлённом видеоруководстве "Работа с AMRcloud". Работа с обновлениями показана ближе к концу роликов.
https://youtu.be/vdqemjOqnMQ
https://youtu.be/zjI-k6lSM4Q
YouTube
Вкладка "Антибиотики (все)" [СУБТИТРЫ]
Видеоруководство «Работа с AMRcloud».
Тема: «Вкладка "Антибиотики (все)"».
Тема: «Вкладка "Антибиотики (все)"».
🎉 Июньское обновление платформы для анализа пользовательских данных антибиотикорезистентности #AMRcloud:
✅Добавлен новый аналитической модуль "Экспертная система", который позволяет автоматически находить ошибки и несоответствия в фенотипических данных антибиотикорезистентности ‼(для активации вкладки "Экспертная система", необходимо сбросить 4 шаг редактирования набора данных и проставить галку "Проверить данные с использованием экспертной системы")‼
✅Добавлена возможность выбора сортировки отображения круговых диаграмм на вкладке "Структура данных" (по количеству или по наименованию);
✅При добавлении графика в дашборд по умолчанию выбирается последний используемый дашборд;
✅Добавлена возможность изменить название созданного ранее графика в дашборде;
✅Добавлена возможность изменения размера шрифтов на осях Х и Y (на интерактивных графиках);
✅Доступно опциональное выключение отображения 95% ДИ.
✅Добавлен новый аналитической модуль "Экспертная система", который позволяет автоматически находить ошибки и несоответствия в фенотипических данных антибиотикорезистентности ‼(для активации вкладки "Экспертная система", необходимо сбросить 4 шаг редактирования набора данных и проставить галку "Проверить данные с использованием экспертной системы")‼
✅Добавлена возможность выбора сортировки отображения круговых диаграмм на вкладке "Структура данных" (по количеству или по наименованию);
✅При добавлении графика в дашборд по умолчанию выбирается последний используемый дашборд;
✅Добавлена возможность изменить название созданного ранее графика в дашборде;
✅Добавлена возможность изменения размера шрифтов на осях Х и Y (на интерактивных графиках);
✅Доступно опциональное выключение отображения 95% ДИ.
👏3👎1
✳️ На платформе #AMRcloud опубликован новый открытый проект «Основные грамотрицательные бактериальные патогены, изолированные из дыхательных путей пациентов с муковисцидозом».
https://amrcloud.net/ru/project/muco-v/
В данном проекте представлены результаты исследования чувствительности к антибиотикам основных грамотрицательных бактериальных патогенов, выделенных из дыхательных путей пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации (Pseudomonas aeruginosa, Achromobacter spp., Burkholderia cepacia complex и Stenotrophomonas maltophilia).
https://amrcloud.net/ru/project/muco-v/
В данном проекте представлены результаты исследования чувствительности к антибиотикам основных грамотрицательных бактериальных патогенов, выделенных из дыхательных путей пациентов с муковисцидозом в Российской Федерации (Pseudomonas aeruginosa, Achromobacter spp., Burkholderia cepacia complex и Stenotrophomonas maltophilia).
👏1
💥 Всем пользователям ЛИС «Патоген» теперь доступна выгрузка отчётов в #AMRcloud!
📝 Подробное руководство, как это сделать, читайте по ссылке:
https://amrcloud.net/ru/tutorials/integrations/patogen-lis/
📝 Подробное руководство, как это сделать, читайте по ссылке:
https://amrcloud.net/ru/tutorials/integrations/patogen-lis/
👍1
✳ Уважаемые коллеги!
В онлайн-платформу #AMRcloud добавлен функционал для обработки повторных изолятов. Теперь на втором шаге загрузки/редактирования данных вы можете исключить повторные изоляты на основании пар-столбцов [идентификатор объекта]-[локус инфекции].
⚠ Повторные изоляты — это изоляты, выделенные из одного локуса инфекции у одного пациента и принадлежащие к одному виду. Выявление повторных изолятов в исходной таблице важно, т.к. их наличие приводит к завышению рассчитанной доли резистентных изолятов.
https://amrcloud.net/
В онлайн-платформу #AMRcloud добавлен функционал для обработки повторных изолятов. Теперь на втором шаге загрузки/редактирования данных вы можете исключить повторные изоляты на основании пар-столбцов [идентификатор объекта]-[локус инфекции].
⚠ Повторные изоляты — это изоляты, выделенные из одного локуса инфекции у одного пациента и принадлежащие к одному виду. Выявление повторных изолятов в исходной таблице важно, т.к. их наличие приводит к завышению рассчитанной доли резистентных изолятов.
https://amrcloud.net/
👍4
🎉✨Платформа #AMRcloud отмечает своё трёхлетие!🍾
До 13 января 2020 года существовала ровно лишь одна карта антибиотикорезистентности — #AMRmap.
Однако за три года, благодаря вашему участию и нашим стараниям, появилось более 1200 таких локальных «карт» с возможностью анализа и обмена данными.
За этот короткий срок платформа AMRcloud превратилась из простого веб-инструмента в основную движущую силу мониторинга антибиотикорезистентности.
📊 Более 15 тыс. человек со всего мира уже открыли для себя AMRcloud — сделайте это и вы! https://amrcloud.net/ru/
До 13 января 2020 года существовала ровно лишь одна карта антибиотикорезистентности — #AMRmap.
Однако за три года, благодаря вашему участию и нашим стараниям, появилось более 1200 таких локальных «карт» с возможностью анализа и обмена данными.
За этот короткий срок платформа AMRcloud превратилась из простого веб-инструмента в основную движущую силу мониторинга антибиотикорезистентности.
📊 Более 15 тыс. человек со всего мира уже открыли для себя AMRcloud — сделайте это и вы! https://amrcloud.net/ru/
👏23👍4❤2
🎉 Уважаемые коллеги!
Теперь пользователи #AMRcloud могут использовать свои данные из платформы для заполнения отчета в «Cистеме годовых отчетов для главного внештатного специалиста Министерства здравоохранения Российской Федерации по клинической микробиологии и антимикробной резистентности» specialist.antibiotic.ru
📝 Порядок действий описан в соответствующем руководстве https://amrcloud.net/ru/tutorials/integrations/reports/
Теперь пользователи #AMRcloud могут использовать свои данные из платформы для заполнения отчета в «Cистеме годовых отчетов для главного внештатного специалиста Министерства здравоохранения Российской Федерации по клинической микробиологии и антимикробной резистентности» specialist.antibiotic.ru
📝 Порядок действий описан в соответствующем руководстве https://amrcloud.net/ru/tutorials/integrations/reports/
AMRcloud
Импорт данных из AMRcloud в систему годовых отчетов | AMRcloud
Руководство рассказывает о том, как имеющиеся у вас данные в AMRcloud можно использовать для заполнения отчета в системе годовых отчетов для главного внештатного специалиста Министерства здравоохранения Российской Федерации по клинической микробиологии и…
👍4🔥4
💡Январское обновление платформы для анализа пользовательских данных антибиотикорезистентности #AMRcloud:
https://amrhub.ru/blog/2023/01/31/cloud31012023/
https://amrhub.ru/blog/2023/01/31/cloud31012023/
AMRhub
Январский пакет обновлений
Виртуальная точка входа для экосистемы уникальных веб-продуктов, посвященных вопросам антимикробной резистентности.
❤8🔥2🤣1
⚠ В онлайн-платформе #AMRcloud стали доступны критерии EUCAST v.13.0 (2023).
https://amrcloud.net/ru/
https://amrcloud.net/ru/
👍14👏4🔥1
💡 На платформе #AMRcloud обновились данные в открытом проекте «Исследование DeMaRes» (анализ распространенности мутаций резистентности к макролидам и фторхинолонам у Mycoplasma genitalium и Mycoplasma pneumoniae). Теперь база данных проекта содержит информацию о мониторинге устойчивости микоплазм из 25 городов России и Беларуси — в этом году в команду исследователей добавились два новых центра из Минска и Санкт-Петербурга.
https://amrcloud.net/ru/project/demares/
🎓 Координатор проекта:
Эйдельштейн Инна Александровна (к.б.н., руководитель лаборатории молекулярной диагностики НИИАХ).
⚠️ Если вы хотите присоединиться к проекту, то вам необходимо связаться с его координатором по электронной почте, указанной на странице с описанием проекта.
https://amrcloud.net/ru/project/demares/
🎓 Координатор проекта:
Эйдельштейн Инна Александровна (к.б.н., руководитель лаборатории молекулярной диагностики НИИАХ).
⚠️ Если вы хотите присоединиться к проекту, то вам необходимо связаться с его координатором по электронной почте, указанной на странице с описанием проекта.
👍11
✳️ На платформе #AMRcloud появились два новых открытых проекта с результатами исследования циркулирующих в стационарах России, Беларуси и Казахстана клинических штаммов Klebsiella pneumoniae:
📌 Klebsiella pneumoniae: анализ маркеров резистентности и вирулентности на основе данных геномного секвенирования
https://amrcloud.net/ru/project/kpn-2/
📌 Klebsiella pneumoniae: Генетическое разнообразие и чувствительность к антибиотикам
https://amrcloud.net/ru/project/kpn-1/
📌 Klebsiella pneumoniae: анализ маркеров резистентности и вирулентности на основе данных геномного секвенирования
https://amrcloud.net/ru/project/kpn-2/
📌 Klebsiella pneumoniae: Генетическое разнообразие и чувствительность к антибиотикам
https://amrcloud.net/ru/project/kpn-1/
👍14❤2🔥2
💻💡Уважаемые коллеги!
Хорошо известные вам #AMRexpert, #AMRcloud, #AMRnote, #AMRmap и др. программные продукты, разработанные специалистами НИИАХ, были бы невозможны без структурирования и систематизации информации. За годы работы мы оцифровали и обработали большой объем разноформатных данных в области микробиологической диагностики и антимикробной терапии, и поэтому как никто понимаем важность стандартизации процесса обмена такими данными.
✅Совместно с @cniioiz (ЦНИИОИЗ) мы подготовили справочник «Антимикробные препараты, которые используются для определения чувствительности». Данный справочник является официальным изданием Минздрава и предназначен для разработчиков оборудования и информационных систем. Созданный справочник — это лишь первый шаг в стандартизации обмена данными в области диагностики антимикробной резистентности и антимикробной терапии.
https://nsi.rosminzdrav.ru/dictionaries/1.2.643.5.1.13.13.99.2.1095/passport/1.3
❓Вопросы по наполнению и корректировке данного справочника доступны для обсуждения на нашем форуме в разделе «Нормативно-справочная информация (справочники НСИ)»
forum.amrhub.ru
Хорошо известные вам #AMRexpert, #AMRcloud, #AMRnote, #AMRmap и др. программные продукты, разработанные специалистами НИИАХ, были бы невозможны без структурирования и систематизации информации. За годы работы мы оцифровали и обработали большой объем разноформатных данных в области микробиологической диагностики и антимикробной терапии, и поэтому как никто понимаем важность стандартизации процесса обмена такими данными.
✅Совместно с @cniioiz (ЦНИИОИЗ) мы подготовили справочник «Антимикробные препараты, которые используются для определения чувствительности». Данный справочник является официальным изданием Минздрава и предназначен для разработчиков оборудования и информационных систем. Созданный справочник — это лишь первый шаг в стандартизации обмена данными в области диагностики антимикробной резистентности и антимикробной терапии.
https://nsi.rosminzdrav.ru/dictionaries/1.2.643.5.1.13.13.99.2.1095/passport/1.3
❓Вопросы по наполнению и корректировке данного справочника доступны для обсуждения на нашем форуме в разделе «Нормативно-справочная информация (справочники НСИ)»
forum.amrhub.ru
👍17❤5🔥3
🐟🐰🐴Уважаемые коллеги! На платформе #AMRcloud произошло большое обновление открытого проекта @fgbu_vgnki «Ветеринарный мониторинг и анализ риска антибиотикорезистентности зоонозных бактерий». Проект был дополнен данными за 2022 и 2023 годы по 2629 изолятам.
Список обновлений:
✅ добавлен новый микроорганизм Listeria monocytogenes
✅ добавлены данные по изолятам , выделенным из объектов внутренней среды предприятий (смывы с поверхностей, оборудования), пищевой продукции, входящего материала (кормов, чистой подстилки, воды), а также почвы, отобранной в месте выпаса животных
✅ появились дополнительные данные по изолятам от лошадей, кроликов и рыб
✅ география исследований расширилась на три региона России и зарубежные страны: Беларусь, Иран и Турцию
✅ добавлено два новых антибиотика: вирджиниамицин и бацитрацин
Ссылка на проект: https://amrcloud.net/ru/project/vgnki/
Список обновлений:
✅ добавлен новый микроорганизм Listeria monocytogenes
✅ добавлены данные по изолятам , выделенным из объектов внутренней среды предприятий (смывы с поверхностей, оборудования), пищевой продукции, входящего материала (кормов, чистой подстилки, воды), а также почвы, отобранной в месте выпаса животных
✅ появились дополнительные данные по изолятам от лошадей, кроликов и рыб
✅ география исследований расширилась на три региона России и зарубежные страны: Беларусь, Иран и Турцию
✅ добавлено два новых антибиотика: вирджиниамицин и бацитрацин
Ссылка на проект: https://amrcloud.net/ru/project/vgnki/
👍11❤3🔥1
🎉🎓 14-16 ноября 2023 в Москве прошла Международная научно-практическая конференция MLDx по молекулярной диагностике в России, в которой приняли участие сотрудники НИИАХ с докладами об устойчивости Mycoplasma genitalium к антибиотикам и молекулярной эпидемиологии Klebsiella pneumoniae.
📌 Эйдельштейн Инна Александровна — руководитель лаборатории молекулярной диагностики НИИАХ (Смоленск)
📌 Шайдуллина Эльвира Расиловна — научный сотрудник НИИАХ (Смоленск)
📌 Эйдельштейн Михаил Владимирович — руководитель лаборатории антибиотикорезистентности НИИАХ (Смоленск)
Напоминаем, что на сайте платформы #AMRcloud есть открытые для просмотра и анализа проекты, посвящённые Klebsiella pneumoniae:
🔗 https://clck.ru/36brjH
🔗 https://clck.ru/36brjs
и микоплазмам:
🔗 https://clck.ru/36bram
📌 Эйдельштейн Инна Александровна — руководитель лаборатории молекулярной диагностики НИИАХ (Смоленск)
📌 Шайдуллина Эльвира Расиловна — научный сотрудник НИИАХ (Смоленск)
📌 Эйдельштейн Михаил Владимирович — руководитель лаборатории антибиотикорезистентности НИИАХ (Смоленск)
Напоминаем, что на сайте платформы #AMRcloud есть открытые для просмотра и анализа проекты, посвящённые Klebsiella pneumoniae:
🔗 https://clck.ru/36brjH
🔗 https://clck.ru/36brjs
и микоплазмам:
🔗 https://clck.ru/36bram
👏12🔥1
💥 Мы всегда рады приветствовать нового партнера из индустрии, поэтому сообщаем что в Лабораторной Информационной Системе «qMS» (компании СП.АРМ) теперь есть возможность экспортировать результаты проведенных микробиологических исследований в файл формата #AMRcloud для последующей загрузки и анализа данных.
Подробности и ссылка на руководство по экспорту:
https://amrcloud.net/ru/post/20231031-qms/
Подробности и ссылка на руководство по экспорту:
https://amrcloud.net/ru/post/20231031-qms/
🔥10👍3