💻 NVIDIA и DeepMind открыли 3D-структуры белков 2800 вирусов

NVIDIA присоединилась к коалиции с Google DeepMind и EMBL-EBI, чтобы выложить в открытый доступ предсказанные 3D-структуры белковых комплексов более чем 2800 вирусов. Данные добавлены в базу AlphaFold Database и доступны любому исследователю.

Структуры получены моделью AlphaFold2, а масштабирование расчётов на тысячи вирусных протеомов обеспечил NVIDIA BioNeMo Inference Runtime. Отдельно NVIDIA открыла BioNeMo Structure Prediction Pipeline - GPU-ускоренный пайплайн, который позволяет пройти путь от последовательности белка до предсказанной 3D-структуры для собственных задач. Если классическая кристаллография требует лет и тысяч долларов на структуру, то AlphaFold2 считает её за минуты и пачками.

Около 30% новых взаимодействий белков ранее не встречались в Protein Data Bank. В проекте участвуют CEPI, Seoul National University, Swiss Institute of Bioinformatics и University of Glasgow; сама база AlphaFold уже содержит свыше 260 млн предсказаний.

#AI #Science #NVIDIA #AlphaFold #BioNeMo